Bioorganic Chemistry
The Widmalm Research Group
Stockholm University » Organic Chemistry » The Widmalm Group » ECODAB
Stockholm University » Organic Chemistry » The Widmalm Group » ECODAB
| Serogroup | O73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Serotype | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Strain | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ECODAB# | 118 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure |
aDGlc(1->4) aDGlc(1->3)
| |
->6)aDMan(1->2)aDMan(1->2)bDMan(1->3)aDGlcNAc-(1->
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CarbBank | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| LinucsID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Non-sugar components | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Comments | Structure[1] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identical to | The DNA sequence of O73, O77 and O106 are almost(>99%) identical. From [1] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-reacts with | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1H-NMR | 5.15 4.12 3.89 3.99 3.98 3.60 4.12 5.35 4.09 4.30 3.94 3.85 3.78 3.87 4.89 4.03 3.95 3.53 3.76 3.78 3.87 5.24 3.56 3.65 3.43 3.76 3.78 3.87 5.23 3.58 3.54 3.43 3.76 3.78 3.87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Conditions | Solvent: D2O; Temp.: 27C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reference | acetone=2.225ppm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Comment | [1] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 13C-NMR | 102.9 71.5 77.0 67.3 72.9 66.3 99.3 78.2 71.7 77.2 73.2 62.0 101.1 74.8 81.6 68.3 78.0 62.3 98.3 54.4 81.4 70.1 73.2 62.0 101.4 73.4 74.5 70.8 74.2 62.0 101.9 72.7 74.7 70.9 74.2 62.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Conditions | Solvent: D2O; Temp.: 27C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reference | acetone=31.45ppm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Comment | [1] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| wzx (flippase) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TrEMBL entry | Q1L823 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence | MIKEIFSDGIFSLFNKICYFGFKTLAIILITRSLGEDVGGEFIFLVGFLEVLRVVTDFGVDLFVIKKYND STDKIKLLNVTFAQKILSGVIVLLLFCLYSFVQGYQYNVYIPIVLALPVALFFNFSNSYFQSLNSNKSLT FPIAIASIATCTIFAIQYFFNVKFNAWDYLCVELLFVSLVTLKLFVSVKFRFIRTSAFDVLMSILSLYKY TLSIGLTAVVVIIYSRIDNFYLKTFAPGDLAAYGQIFRMVDPLVMVSSVFSTVAYARFCRINLQEKNTFT KVFQFLLCIVAYGVLSSLVYFFIIKYLGHFVLISNVNNDFLIMMFLIVACVKCINGGTTAIIQSQGFYKV GLYVSYVCILTSIPTMYFLIMKYGVKGAAMTILLVECISFILLLCSFFMIKKMRP |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| wzy (polymerase) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TrEMBL entry | Q1L824 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence | MHKQYYLLLCNKIQFKHLAIYFSVFLSLSSCFLWGGADTFVSQVYIDILATISTALLVILMFYYYINRVR YLSLTLLFAFVFSLIIGLPSIYLYYFKNANHGFEIICIWGMLINSILYLQTTETVIKEEKRYLTSLFYIL FSIVALCQLYKILIYLMFILNSGEGHLAIYTESEELLSQVPFFIRAISGFAVVMSLSTFYFKTPTYIKVI AFVLLASDLAIGIRNKFFFSVICIFILYMYSNEYRVRNLFKQLSKPIFLIAGFLCFSMVSYFREGYQIDF MIYIGIVLDSLSSTLGGMQNLFDMQSSGWDQLHPAVVFTQVLPLSGLGFLDDQQIAKDFSIIVLGDVSSG IALSSSGLLESSLLSLNLGVIIYLLYLSGVMLFIKWGLNNQRIIINFVAISMISGFFYAVRGELILPLAF LLKSLPIVLISPLLVKNKIYHGQ |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Comment | From [1] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | [1] Microbiology.153 (2007) 2159–2167 [PubMed 17600060] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||